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近三年来，胃肠道细菌G540成为生物科学科学研究应用领域的领涨板块，但目前大部分科学研究都集中在使用字章定序控制技术展开亚种和机能的导出，宏DNA组的堆叠产品质量相对较低并且极难实现大肠杆菌水准的机能差别预测。

加夫赖县，中国科学院细菌科学研究院张勇研究组和动物科学研究院宋默识研究组合作，建立了ONT四代定序和Illumina字章定序统计数据混和装配和先期预测业务流程。在mock community上的校正表明，四代和字章定序统计数据的混和装配从完备度、精确程度和代码表面积方面均比纯粹字章或者四代定序装配更有优势。

图1 本科学研究的控制技术走线（a）,借助四代定序展开SV的广度导出，和横切面/时间字符串中SV的组成、屈艾，最终展开SV对新陈代谢机能的负面影响认定。(b) 混和装配能够有效提升N50，并装配出大批的DNA组（c），其中辨认出更多的insertion、deletion和inversion。

图2 胃肠道细菌中与SVs有关的机能科学研究结论。(a,b,c) SV负面影响DNA含水结论; (d-i) SV负面影响单微生物内不同大肠杆菌与新陈代谢乙醛和血压的关连。

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该科学研究如前所述四代ONT字符串，提升了宏DNA装配的产品质量、SV的辨认出能力，辨认出了大批包括填入突变和DNA倒位其中的结构突变对于大肠杆菌水准上DNA机能的负面影响，和遗传物质、CRISPR-spacer等系统的广度发掘。此项科学研究是研究组借助四代Nanopore定序控制技术导出胃散发性组（Cao et al., Medicine in Microecology, 2020, 4:100012; Cao et al. Gut Microbes, 2021, 13），近期发表的霉菌组预测方法（Lu et al, Molecular Ecology, doi:10.1111/mec.16534）和抗肿瘤RNA检验病原体细菌（Zhao et al., Advanced Science, 2021, 8, 2102593）之后，在借助四代Nanopore定序控制技术积极探索胃肠道细菌科学研究应用领域的重大进展。这一辨认出，对未来更精巧的精确药理学应用领域的发展提供了理论启迪。

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